„sequence alignment“

Suchergebnisse

600 Treffer

• Indexable Elastic Founder Graphs of Minimum Height
  Rizzo, Nicola ; Mäkinen, Veli 2022 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Algorithms for Normalized Multiple Sequence Alignments
  Araujo, Eloi ; Rozante, Luiz C. ; Rubert, Diego P. ; Martinez, Fábio V. 2021 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Tree Diet: Reducing the Treewidth to Unlock FPT Algorithms in RNA Bioinformatics
  Marchand, Bertrand ; Ponty, Yann ; Bulteau, Laurent 2021 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Fine-Grained Hardness for Edit Distance to a Fixed Sequence
  Abboud, Amir ; Vassilevska Williams, Virginia 2021 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Near-Linear Time Edit Distance for Indel Channels
  Ganesh, Arun ; Sy, Aaron 2020 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• A statistical score for assessing the quality of multiple sequence alignments
  Ahola, Virpi ; Aittokallio, Tero ; Vihinen, Mauno ; Uusipaikka, Esa
• Faster Pan-Genome Construction for Efficient Differentiation of Naturally Occurring and Engineered Plasmids with Plaster
  Wang, Qi ; Elworth, R. A. Leo ; Liu, Tian Rui ; Treangen, Todd J. 2019 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Validating Paired-End Read Alignments in Sequence Graphs
  Jain, Chirag ; Zhang, Haowen ; Dilthey, Alexander ; Aluru, Srinivas 2019 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Bounded-Length Smith-Waterman Alignment
  Tiskin, Alexander 2019 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Outlier Detection in BLAST Hits
  Shah, Nidhi ; Altschul, Stephen F. ; Pop, Mihai 2017 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Better Greedy Sequence Clustering with Fast Banded Alignment
  Brubach, Brian ; Ghurye, Jay ; Pop, Mihai ; Srinivasan, Aravind 2017 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• On Almost Monge All Scores Matrices
  Carmel, Amir ; Tsur, Dekel ; Ziv-Ukelson, Michal 2016 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Aligning Flowgrams to DNA Sequences
  Martin, Marcel ; Rahmann, Sven 2013 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• Alignment-free sequence comparison with spaced k-mers
  Boden, Marcus ; Schöneich, Martin ; Horwege, Sebastian ; Lindner, Sebastian ; Leimeister, Chris ; Morgenstern, Burkhard 2013 Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik
• 25 Years of the Burrows-Wheeler Transform (Dagstuhl Seminar 19241)
  Gagie, Travis ; Manzini, Giovanni ; Navarro, Gonzalo ; Stoye, Jens
• A New Quantum Cuckoo Search Algorithm for Multiple Sequence Alignment
  Kartous, Widad ; Layeb, Abdesslem ; Chikhi, Salim
• Efficient mapping of genomic sequences to optimize multiple pairwise alignment in hybrid cluster platforms
  Montañola, Alberto ; Roig, Concepció ; Hernández, Porfidio
• Parallel Niche Pareto AlineaGA – an Evolutionary Multiobjective approach on Multiple Sequence Alignment
  Silva, Fernando José Mateus da ; Pérez, Juan Manuel Sánchez ; Pulido, Juan Antonio Gómez ; Rodríguez, Miguel A. Vega
• X-Mapper: fast and accurate sequence alignment via gapped x-mers
  Gaston, Jeffry M. ; Alm, Eric J. ; Zhang, An-Ni
• Read mapping
  Hoffmann, Steve ; Stadler, Peter F.